Школа N 3 – старейшая в городе. В 1938году она приняла своих первых питомцев. А уже в 1941 году состоялся первый выпуск единственного 10 класса, большинство юношей и девушек вместе со своими учителями ушли защищать рубежи Родины. С фронтов Великой Отечественной войны не вернулись 7 учителей и 13 учащихся.
В 1943 году поселок Сельцо был сожжен, вместе с ним сгорела и школа. В 1944 году разрушенная школа была восстановлена частично силами учителей, учащихся и жителей поселка. На тот момент это было единственное образовательное учреждение, в котором обучались дети поселка Сельцо, окружающих сел и деревень. В 1945-46 году в выпускном классе школы было 5 учеников, в 1948 году в первые классы пришло 130 детей.
С 1952 по 1962 год школа именовалась «Сельцовской семилетней школой N1», с 1962 - 1963 уч. год «Сельцовская восьмилетней школой N1», с 1963 по 1965 г.г. называлась «Восьмилетней школой N61 г. Брянска». 1 сентября 1972 года школа стала именоваться «Сельцовская средняя школа N3»
Под умелым руководством директора учителя и учащиеся школы стабильно занимают призовые места в различных городских, региональных, всероссийских конкурсах и соревнованиях.
МБОУ СОШ №3 – победитель конкурса «Общеобразовательные учреждения, активно внедряющие инновационные образовательные программы»
В 2006-07 уч.году – школа получила грант губернатора Брянской области